Existen 20 diferentes factores de los cuales 12 son vitales para la coagulación normal de la sangre; cuando uno o varios de estos se encuentra ausente, su síntesis o función es deficiente, puede existir sangrado excesivo y conducir a trastornos severos de coagulación, que pueden ser hereditarios o adquiridos, moderados o graves y permanentes o transitorios. El factor IX de la coagulación es dependiente de la vitamina K y se sintetiza en el hígado, su activación es calcio-dependiente y consiste en su proteólisis catalizada por el factor XIa y por el complejo factor VII/factor tisular. El factor IX activado (FIXa) en combinación con el factor VIII activado (F VIIIa), activa el factor X, esto resulta principalmente en la conversión de protrombina a trombina, la cual posteriormente convierte el fibrinógeno a fibrina para formar el coágulo. La deficiencia de factor IX ocasiona la hemofilia B, enfermedad hereditaria de transmisión ligada al cromosoma X, que afecta los hombres y las mujeres son portadoras. De igual manera, puede ser adquirida debido a niveles reducidos por enfermedad hepática que impide la síntesis del factor IX, inhibidores del factor IV y terapia con anticoagulante cumadin. La severidad de los síntomas se correlaciona directamente con la prolongación del tiempo de coagulación APTT, pacientes levemente afectados pueden mostrar sangrado excesivo en situaciones de traumas o cirugías. La prueba es de utilidad para determinar los niveles séricos del factor IX, confirmar la deficiencia y en el monitoreo de pacientes en tratamiento.